神秘的EVA零号机驾驶员绫波丽，在与碇元度约定之时，来到了NERV底层中央教条的红色水池边。她的命运似乎就将在此结束。
在危急时刻，葛城美里不但要完成加持良治交待的对“第二次浩劫”真相以及“人类补完计划”的探查工作，还要保护碇真嗣与明日香，以及防备SEELE 对初号机与二号机的物理接触。
出于对碇元度的憎恨，赤木律子接受了SEELE引爆MAGI的提案，她能否成功？长期与SEELE共事的碇元度、冬月耕造、碇唯，为了防止人类“最终的悲剧”，而酝酿了的“人类补完计划”能否实现？尽在《新世纪福音战士》电影版第2部中解答。
村瀬步,石川界人,日野聪,细谷佳正,齐藤壮马,内山昂辉,入野自由,林勇,冈本信彦,名冢佳织,诸星堇,神谷浩史,田中一成,竹内良太,丹沢晃之,木村昴,土屋神叶,丰永利行,大森大树,福田贤二,寺岛拓笃
杉田智和 / 阪口大助 / 钉宫理惠 / 中井和哉 / 铃村健一 / 小林优 / 雪野五月 / 太田哲治 / 石田彰 / 高松信司 / 子安武人 / 山崎巧 / 清水理沙 / 茶风林
竹内顺子,杉山纪彰,中村千绘,井上和彦,关俊彦,松本和香子,大塚芳忠,胜生真沙子,柴田秀胜,森久保祥太郎,伊藤健太郎,柚木凉香,小杉十郎太,增川洋一,远近孝一,田村由香里,江原正士,水树奈奈,鸟海浩辅,川田绅司,落合露美,大谷育江,重松朋,下屋则子,飞田展男,石冢运升,浅野真由美,石田彰,加濑康之,朴璐美,中田让治,保志总一朗,神奈延年,三木真一郎,中村大树,家中宏,福田信昭,楠大典,本田贵子,平
内详
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村瀬步,石川界人,日野聪,入野自由,林勇,细谷佳正,内山昂辉,齐藤壮马,名冢佳织,神谷浩史,江川央生,中村悠一,梶裕贵,竹内良太,增田俊树,诸星堇,木村良平,逢坂良太,西山宏太朗,古川慎,田丸笃志,木村昴,土屋神叶,寺岛拓笃,中尾隆圣,兴津和幸,花江夏树,宫野真守,鸟海浩辅,上村祐翔
中村悠一,樱井孝宏,远藤绫,永濑安娜,子安武人
柿原彻也 / 平野绫 / 中村悠一 / 大原沙耶香 / 钉宫理惠 / 堀江由衣
花江夏树,鬼头明里,下野纮,松冈祯丞,樱井孝宏,小西克幸,河西健吾,早见沙织,花泽香菜,铃村健一,关智一,杉田智和
上村祐翔,山村响,浦和希
田村睦心,入野自由,本泉莉奈,七海弘希,福原绫香,钉宫理惠,竹内荣治,日野聪,白熊宽嗣,河西健吾,青山吉能,田中敦子
结川麻希,比嘉良介,梶裕贵
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花江夏树,真野步,大塚芳忠,水濑祈,仓持若菜,神谷浩史,内田雄马,日笠阳子,甲斐田裕子
三木真一郎,能登麻美子,三上枝织,东山奈央
藤原夏海,坂泰斗,佳穂成美,冈咲美保,花泽香菜,东地宏树